پاریس: محققان فرانسوی نوع جدیدی از کووید را شناسایی کرده‌اند که احتمالاً منشأ کامرونی دارد و به طور موقت آن را “IHU” نامیده‌اند.
بر اساس مطالعه‌ای که هنوز مورد بازبینی قرار نگرفته و توسط دولت فرانسه حمایت شده است، تصور می‌شود که نوع جدید این دودمان به نام B.1.640.2 12 نفر را در کشور آلوده کرده است.
دارای 46 جهش و 37 حذف است. فیلیپ کولسون، از IHU Mediterranee Infection، مارسی، فرانسه گفت: «برای دوازده بیمار SARS-CoV مثبت که در همان منطقه جغرافیایی جنوب شرقی فرانسه زندگی می‌کنند، آزمایش qPCR آن غربالگری برای جهش‌های مرتبط با انواع مختلف، ترکیبی غیر معمول را نشان داد.
کولسون گفت، با این حال، “هنوز زود است که بر اساس این 12 مورد، درباره ویژگی های ویروسی، اپیدمیولوژیک یا بالینی این نوع IHU حدس بزنیم.”
بر اساس این مطالعه، مورد شاخص (نخستین بیمار) یک بزرگسال واکسینه شده بود که از سفر به کامرون در آفریقای مرکزی به فرانسه بازگشته بود.
سه روز پس از بازگشت علائم تنفسی خفیفی در او ایجاد شد. کولسون گفت که نمونه نازوفارنکس او در اواسط نوامبر 2021 جمع آوری شد، “یک ترکیب غیر معمول را نشان داد که با الگوی نوع دلتا که تقریباً در تمام عفونت های SARS-CoV-2 در آن زمان دخیل بود، مطابقت نداشت” و بعداً به Omicron نیز رسید.
نمونه‌های تنفسی جمع‌آوری‌شده از هفت بیمار دیگر مبتلا به SARS-CoV-2 که در همان منطقه جغرافیایی زندگی می‌کردند، همان ترکیبی از جهش‌های غربالگری شده توسط qPCR را نشان دادند. آنها دو بزرگسال و پنج کودک (زیر 15 سال) بودند.
طبق توصیه مقامات بهداشت عمومی فرانسه، نمونه‌های تنفسی این هشت بیمار برای تعیین توالی ژنوم SARS-CoV-2 به مؤسسه بیمارستان دانشگاهی عفونت مدیترانه فرستاده شد.
آزمایشات بیشتر منجر به شناسایی ژنوتیپ SARS-CoV-2 شد. تجزیه و تحلیل 46 جهش و 37 حذف را نشان داد که منجر به 30 جایگزینی اسید آمینه و 12 حذف شد. چهارده جایگزین اسید آمینه، از جمله N501Y و E484K، و 9 حذف در پروتئین اسپایک قرار دارند.
“این الگوی ژنوتیپ منجر به ایجاد یک دودمان جدید پانگولین به نام B.1.640.2 شد که یک گروه خواهر فیلوژنتیک به دودمان قدیمی B.1.640 با تغییر نام B.1.640.1 است. هر دو دودمان با 25 جایگزینی نوکلئوتیدی و 33 حذف متفاوت هستند.” مطالعه گفت.
کولسون گفت: «مجموعه جهش و موقعیت فیلوژنتیک ژنوم‌های به‌دست‌آمده در اینجا، بر اساس تعریف قبلی ما، نوع جدیدی را نشان می‌دهد که «IHU» نامیده‌ایم.»
وی افزود که این داده ها «نمونه دیگری از غیرقابل پیش بینی بودن ظهور گونه های SARS-CoV-2» است.
کولسون گفت: «به طور کلی، این مشاهدات یک بار دیگر غیرقابل پیش‌بینی بودن ظهور گونه‌های جدید SARS-CoV-2 و معرفی آنها از خارج از کشور را نشان می‌دهد و دشواری کنترل چنین معرفی و گسترش بعدی را نشان می‌دهد.»
واریته‌های SARS-CoV-2 به یک نگرانی اصلی ویروس‌شناسی، اپیدمیولوژیک و بالینی تبدیل شده‌اند، به‌ویژه با توجه به خطر فرار از ایمنی ناشی از واکسن. ظهور نوع جدید افزایش نظارت ژنومی SARS-CoV-2 را تضمین می‌کند. ،” او گفت.
بر اساس مطالعه‌ای که هنوز مورد بازبینی قرار نگرفته و توسط دولت فرانسه حمایت شده است، تصور می‌شود که نوع جدید این دودمان به نام B.1.640.2 12 نفر را در کشور آلوده کرده است.
دارای 46 جهش و 37 حذف است. فیلیپ کولسون، از IHU Mediterranee Infection، مارسی، فرانسه گفت: «برای دوازده بیمار SARS-CoV مثبت که در همان منطقه جغرافیایی جنوب شرقی فرانسه زندگی می‌کنند، آزمایش qPCR آن غربالگری برای جهش‌های مرتبط با انواع مختلف، ترکیبی غیر معمول را نشان داد.
کولسون گفت، با این حال، “هنوز زود است که بر اساس این 12 مورد، درباره ویژگی های ویروسی، اپیدمیولوژیک یا بالینی این نوع IHU حدس بزنیم.”
بر اساس این مطالعه، مورد شاخص (نخستین بیمار) یک بزرگسال واکسینه شده بود که از سفر به کامرون در آفریقای مرکزی به فرانسه بازگشته بود.
سه روز پس از بازگشت علائم تنفسی خفیفی در او ایجاد شد. کولسون گفت که نمونه نازوفارنکس او در اواسط نوامبر 2021 جمع آوری شد، “یک ترکیب غیر معمول را نشان داد که با الگوی نوع دلتا که تقریباً در تمام عفونت های SARS-CoV-2 در آن زمان دخیل بود، مطابقت نداشت” و بعداً به Omicron نیز رسید.
نمونه‌های تنفسی جمع‌آوری‌شده از هفت بیمار دیگر مبتلا به SARS-CoV-2 که در همان منطقه جغرافیایی زندگی می‌کردند، همان ترکیبی از جهش‌های غربالگری شده توسط qPCR را نشان دادند. آنها دو بزرگسال و پنج کودک (زیر 15 سال) بودند.
طبق توصیه مقامات بهداشت عمومی فرانسه، نمونه‌های تنفسی این هشت بیمار برای تعیین توالی ژنوم SARS-CoV-2 به مؤسسه بیمارستان دانشگاهی عفونت مدیترانه فرستاده شد.
آزمایشات بیشتر منجر به شناسایی ژنوتیپ SARS-CoV-2 شد. تجزیه و تحلیل 46 جهش و 37 حذف را نشان داد که منجر به 30 جایگزینی اسید آمینه و 12 حذف شد. چهارده جایگزین اسید آمینه، از جمله N501Y و E484K، و 9 حذف در پروتئین اسپایک قرار دارند.
“این الگوی ژنوتیپ منجر به ایجاد یک دودمان جدید پانگولین به نام B.1.640.2 شد که یک گروه خواهر فیلوژنتیک به دودمان قدیمی B.1.640 با تغییر نام B.1.640.1 است. هر دو دودمان با 25 جایگزینی نوکلئوتیدی و 33 حذف متفاوت هستند.” مطالعه گفت.
کولسون گفت: «مجموعه جهش و موقعیت فیلوژنتیک ژنوم‌های به‌دست‌آمده در اینجا، بر اساس تعریف قبلی ما، نوع جدیدی را نشان می‌دهد که «IHU» نامیده‌ایم.»
وی افزود که این داده ها «نمونه دیگری از غیرقابل پیش بینی بودن ظهور گونه های SARS-CoV-2» است.
کولسون گفت: «به طور کلی، این مشاهدات یک بار دیگر غیرقابل پیش‌بینی بودن ظهور گونه‌های جدید SARS-CoV-2 و معرفی آنها از خارج از کشور را نشان می‌دهد و دشواری کنترل چنین معرفی و گسترش بعدی را نشان می‌دهد.»
واریته‌های SARS-CoV-2 به یک نگرانی اصلی ویروس‌شناسی، اپیدمیولوژیک و بالینی تبدیل شده‌اند، به‌ویژه با توجه به خطر فرار از ایمنی ناشی از واکسن. ظهور نوع جدید افزایش نظارت ژنومی SARS-CoV-2 را تضمین می‌کند. ،” او گفت.